La AAPC es una organización no gubernamental sin fines de lucro. Su conducción es ejercida por un Colegiado Directivo en el que participan otras Sociedades Científicas.

Acorde con la voluntad de los fundadores sus objetivos son:

• Propender al progreso y difusión de las ciencias.
• Fomentar la formación de investigadores mediante becas, subsidios, premios y cualquier otro medio a su alcance.
• Propiciar el acercamiento entre los científicos y las personas interesadas en la ciencia para lograr una mayor integración científica nacional.
• Favorecer la vinculación científica internacional.
• Organizar reuniones para considerar temas de investigación aplicada a desarrollos útiles para el progreso del país.
• Coordinar reuniones científico-técnicas interdisciplinarias.
• Asesorar a los organismos oficiales y privados en aspectos directamente relacionados con el desarrollo científico y técnico.
• Cooperar con la industria para brindar soluciones de carácter científico a la producción.