Jorge Luis Aliaga realizó sus estudios universitarios en la Universidad de Buenos Aires. Allí obtuvo su licenciatura en Física en 1985 y su doctorado en 1988. Ha sido investigador asociado del Centro Internacional de Física Teórica (ICTP), Trieste, Italia, y subsecretario de Evaluación Institucional del Ministerio de Ciencia y Tecnología en 2015. Es Profesor del Departamento de Física de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales (Universidad de Buenos Aires) (FCEN), Investigador Independiente del CONICET​.  Fue representante del claustro de graduados en el Consejo Directivo de la FCEN entre 1992 y 1997, miembro del Consejo Superior de la Universidad de Buenos Aires en 1999, en representación del claustro de profesores, Secretario General de la FCEN entre 2000 y 2006, y ese año asumió como decano de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales, mandato que le fue renovado en 2010 y finalizó el 20 de marzo de 2014. En la actualidad se desempeña como Secretario de Planificación y Evaluación Institucional de la Universidad Nacional de Hurlingham.